1)医治期间不许饮酒。
2)当完成一个疗程后应进行随访。
3)患者是否按时、按量医治。因为的医治不同于淋病能做到短期足量医治，而且服药次数多，持续时间长。
4)由于目前有多达45%的淋病患者在感染淋球菌的同时也感染衣原体和支原体，因此，在医治淋病时，可采取同时医治非淋菌性尿道炎联合方案。
5)性伴侣如有感染应同时医治。经医治，病人的症状持续存在，或症状消失后又反复，可能的原因是性伴侣未经医治。未经治好与性伴侣性交，病菌由未经医治的性伴侣再次传给患者。须知有40％的非淋菌性尿道炎患者是没有任何症状。所以不但患者本身要医治，其性伴侣也应接受预防性的药物医治。方法与患者相同，如为孕妇，可用红霉素或阿莫西林医治。
6)对于已经多所医院医治而未愈的患者。要详细了解病情和疗程，若按正规而无好转或无效者，应改换另一种方法，甚至联合医治。联合医治时一般不要用同类抗生素。
7)若证实为沙眼衣原体尿道炎患者，再次医治时把疗程延长到4—6周可效。
8)已有不少报告分解尿素支原体对四环素有耐药性，若疑属于这种情况，则及时用其他抗生素。
9)如果患者反反复作，应警惕并发症，如前列腺炎等，应做相应的细菌学查，并及时医治。
10)有条件的医疗单位，应对每一患者尤其是反复者做详细的临床和细菌查，并进行针对性的医治，这样才能有用治好。
11)临床表现与非淋菌性尿道炎的症状不相符合，且化验没有查出病原体，考虑是否为神经过敏症，此时要解释、安慰并使用镇静药物，经临床应用博乐欣效果较好。
12)若为滴虫、霉菌或其他少见病，尤其是霉菌性尿道炎，不能一味加用素，否则对患者危害更大，应查清后对症医治。
13)非淋菌性尿道炎医治时不应滥用抗生素，如绝大多数青霉素药物对衣原体、支原体均无效，一般不应使用。